SSR分子量数据处理的简单介绍

2024-10-14

生物分子标记

1、分子标记的概念有广义和狭义之分。广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。狭义分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。分子标记(Molecular Markers),是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的反映。

2、分子标记是一种遗传标记形式,它基于蛋白质和核酸分子的突变,用于检测生物遗传结构及其变异。这种标记技术可以在基因或基因型上识别生物个体之间的差异。每个分子标记都有其独特的特点和应用范围,但一般来说,DNA分子标记具有许多优势,如不受组织类别和发育阶段的影响,也不受环境因素的干扰。

3、分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种较为理想的遗传标记形式,它以蛋白质、核酸分子的突变为基础,检测生物遗传结构与其变异。分子标记技术从本质上讲,都是以检测生物个体在基因或基因型上所产生的变异来反映生物个体之间的差异。

SSR分子标记的原理

SSR分子标记原理:基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列,可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序,根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增,将单个微卫星位点扩增出来。

ssr标记技术的原理如下:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段,由于核心序列串联重复数目不同,因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物,将扩增产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。

SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段,由于核心序列串联重复数目不同,因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物,将扩增产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。

因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带。由此可见,SSR分子标记的基本原理就是要了解SSR座位两侧的核苷酸序列,寻找其中的特异保护区。RFLP的等位基因 其有共显性特点。RFLP标记位点数量不受限制,通常可检测到的基因座位数为1—4个。

由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异,个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性,这一多态性称为简单序列重复长度多态性(SSLP),每一扩增位点就代表了这一位点的一对等位基因。由于SSR重复数目变化很大,所以SSR标记能揭示比RFLP高得多的多态性,这就是SSR标记的原理。

SSR的重复序列

SSR简单序列重复标记(Simple sequence repeat, 简称SSR标记),也叫微卫星序列重复,是由一类由几个核苷酸(1-5个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列,长度较短,广泛分布在染色体上。

根据重复序列的重复单位的长度,可将串联重复序列分为卫星DNA、微卫星DNA、小卫星 DNA等。微卫星DNA又叫简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200 bp以下。

SSR是Simple Sequence Repeat的缩写,意思是简单重复序列标记,SSR是以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence,MS),或短串联重复标记( Short Tandem Repeat,STR)。

简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA) n和(TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。

SSR(Simple Sequence Repeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术,也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸(一般为1~6个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。由于每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列。

ssr扩写法是simple&sequence&repeat。ssr意思是简单重复序列标记,ssr是以pcr技术为核心的dna分子标记技术,或称微卫星序列标记(microsatellite&sequence,mS),或短串联重复标记(short&tandem&repeat,str)。所以ssr扩写法是simple&sequence&repeat。

什么叫生物技术

生物技术是指人们以现代生命科学为基础,结合其他基础科学的科学原理,采用先进的科学技术手段,按照预先的设计改造生物体或加工生物原料,为人类生产出所需产品或达到某种目的。生物技术是人们利用微生物、动植物体对物质原料进行加工,以提供产品来为社会服务的技术。它主要包括发酵技术和现代生物技术。

生物技术(biotechnology)又称生物工程(bioengineering),是以生命科学为基础,利用生物体的特性和功能,设计、构建具有预期性状的新物种、新品种(系),以及与工程原理相结合,加工生产目的产物,为社会提供商品和服务的综合技术体系。

生物技术是利用生物系统、生物过程、生物物质来开发或创建产品、工艺、设备的技术。它融合了生命科学与技术应用,通过对生物体的遗传、生化特性进行研究与应用,开发出各种产品和技术来服务于人类。

生物技术是以生命科学的理论和技术为基础,结合各种现代工程技术,充分运用分子生物学的最新成就,按人类需要提供商品和社会服务的综合性科学技术体系,主要包括基因工程、细胞工程、酶工程、发酵工程和蛋白质工程5个分支领域。生物技术按发展历史可分为传统生物技术和现代生物技术两部分。